ABSTRACT
Abstract Introduction: Epiphytes (vascular and non-vascular) are one of the most diverse groups in the Neotropics, but despite their importance in the functioning of many ecosystems, much of their taxonomy and ecology is still unknown in the dry forest of Colombia. Objective: To compare the diversity patterns and species composition of vascular and non-vascular epiphytes along tropical dry forest remnants of Cauca Valley, Colombia. Methods: Ten permanent plots (50 x 20 m2) were established in tropical dry forest remnants. The epiphytes were sampled in 40-50 trees per plot. Alpha and gamma diversity were calculated using the richness (q0) and Shannon index (q1) (alpha was estimated as the average for phorophytes). Beta diversity was measured using the Whitaker index. To evaluate the relationship between diversities and environmental variables, GLM analysis was used. Results: We found 50 morphospecies of vascular epiphytes, 77 of bryophytes and 290 of lichens. The 𝛼 and 𝛾 diversity of bryophytes from each remnant was significantly explained by temperature. The abundance of lichens per tree was significantly related with the DBH and tree height of each remnant. The 𝛼 diversity of vascular epiphytes shown can be explained by temperature and precipitation. The 𝛾 diversity was strongly influenced by the beta diversity in bryophytes and lichens. This pattern is because the sites with high disturbance present a lower diversity, as a consequence of a homogenizing effect, that is, a low turnover of species between sampling units. Conclusions: Precipitation and temperature affected the diversity of bryophytes and vascular epiphytes, while it did not show a relationship with the lichen's diversity, for which there is not a high congruence between the diversity and composition of these epiphytes.
Resumen Introducción: Los epífitos (vasculares y no vasculares) son uno de los más diversos grupos de plantas en el Neotrópico, pero a pesar de su importancia para el funcionamiento de varios ecosistemas, existen grandes vacíos en su conocimiento taxonómico y ecológico en el bosque seco de Colombia. Objetivo: Comparar los patrones de diversidad y composición de especies de epífitas vasculares y no vasculares a lo largo de remanentes de bosque seco tropical del Valle del Cauca, Colombia. Métodos: Se establecieron diez parcelas permanentes (50 x 20 m2) en remanentes de bosque seco tropical. Las epífitas se muestrearon en 40-50 árboles por parcela. La diversidad alfa y gamma se calculó utilizando la riqueza (q0) y el índice de Shannon (q1) (alfa se estimó como el promedio para los forófitos). La diversidad beta se midió utilizando el índice de Whitaker. Para evaluar la relación entre diversidades y variables ambientales se utilizó el análisis GLM. Resultados: Se encontraron 50 morfoespecies de epífitas vasculares, 77 de briófitas y 290 de líquenes. La diversidad de 𝛼 y 𝛾 de briófitas de cada remanente fue explicada significativamente por la temperatura. La abundancia de líquenes por árbol se relacionó significativamente con el DAP y la altura del árbol de cada remanente. La diversidad 𝛼 de epífitas vasculares que se muestra puede explicarse por la temperatura y la precipitación. La diversidad 𝛾 estuvo fuertemente influenciada por la diversidad beta en briófitas y líquenes. Este patrón se debe a que los sitios con alta perturbación presentan una menor diversidad, como consecuencia de un efecto homogeneizador, es decir, un bajo recambio de especies entre unidades de muestreo. Conclusiones: La precipitación y la temperatura afectaron la diversidad de briófitas y epífitas vasculares, mientras que no mostró relación con la diversidad de líquenes, por lo que no existe una alta congruencia entre la diversidad y composición de estas epífitas.
Subject(s)
Plants/anatomy & histology , Plant Physiological Phenomena , Lichens/growth & development , ColombiaABSTRACT
Abstract Introduction: Enough scientific evidence is available on the harmful effects of air pollution on the health of human beings, fauna, flora, and ecosystems in general. The mechanical and electronical monitoring networks are the first option for the air quality diagnosis, but they do not allow a direct and precise assessment of the impacts in living organisms that may result from the exposure to air pollutants. Objective: To evaluate the changes in the composition of corticulous lichen communities as a response to various stress factors in areas with different levels of air quality to diagnose the state of pollution or intervention in an area with a more complete option. Methods: Air quality contrasts and changes in richness and coverage of corticulous lichens in response to different stress factors, such as land use and distance to roads, in three different biomonitoring areas, were evaluate using GIS, and the data are presented in an easy-to-understand grey scale coded isoline map. Results: Indicators such as lichen coverage (R= -0.4) and richness (R= -0.7) are inverse correlated with PM2.5 concentrations in each area. A total of 110 lichen species were identified, being Phaeophyscia chloantha (Ach.) Moberg and Physcia poncinsii Hue the most frequent species (present in 38 and 33 % of the 86 sampled phorophytes, respectively). The intra-area relationships of lichen richness exhibit significant relationships with regards to the land use and distance to roads (with correlations coefficients greater than 0.5) and the Simpson index was higher than 0.9, in places with better conditions in terms of air quality and microenvironments, likewise the resistance factors calculated suggest that the most sensitive species can be found in environments with a lesser degree of disturbance. Conclusion: These evaluations represent more criteria elements for the diagnosis of the environmental health in the biomonitoring areas.
Resumen Introducción: Existe suficiente evidencia científica de los efectos nocivos de la contaminación atmosférica sobre la salud de los seres humanos, fauna, flora y ecosistemas en general. La primera opción para el diagnóstico de la calidad del aire son las redes de monitoreo mecánicas o electrónicas, pero estas no permiten evaluar de forma directa y precisa el impacto en los organismos vivos como resultado de la exposición a contaminantes del aire. Objetivo: Evaluar los cambios en la composición de las comunidades de líquenes cortícolas como resultado a la exposición de factores de estrés ambiental en áreas con diferentes niveles de calidad del aire para diagnosticar el estado de contaminación o intervención en una zona de una manera más completa. Métodos: Se determinaron los contrastes y cambios en la calidad del aire, la riqueza y cobertura de líquenes cortícolas en respuesta a diferentes factores de estrés, como usos del suelo y distancia a carreteras, en tres diferentes áreas de biomonitoreo, las cuales fueron evaluadas usando GIS. Los datos se presentan en un mapa de isolíneas con códigos en escala de grises fácil de entender. Resultados: Indicadores como cobertura (R= -0.4) y riqueza (R= -0.7) de líquenes están inversamente correlacionados con las concentraciones de PM2.5 en cada área. Se identificaron un total de 110 especies de líquenes, siendo Phaeophyscia chloantha (Ach.) Moberg y Physcia poncinsii Hue las especies más frecuentes (presentes en 38 y 33 % de los 86 forófitos muestreados, respectivamente). Las relaciones intra-área de riqueza de líquenes exhiben relaciones significativas con respecto al uso del suelo y distancia a carreteras (con coeficientes de correlación mayores a 0.5) y el índice de Simpson fue mayor a 0.9, en lugares con mejores condiciones en términos de calidad del aire y microambientes. Asimismo, los factores de resistencia calculados sugieren que las especies más sensibles se pueden encontrar en ambientes con menor grado de perturbación. Conclusión: Estas evaluaciones representan más elementos de criterio para el diagnóstico de la salud ambiental en las áreas de biomonitoreo.
Subject(s)
Air Pollutants , Lichens , ColombiaABSTRACT
Abstract Introduction: Lichen diversity, community structure, composition and species abundance have been used as indicators of the integrity and ecological continuity of tropical forest ecosystems. Objectives: To assess corticolous lichen species composition, diversity, and ecological importance of three forested stands differing in time of abandonment as indicators of how passive restoration influences the lichen community assemblage. Methods: We surveyed individual lichens on tree stems of a reference old secondary forest and a young secondary forest (50 and 14-year-old natural regeneration after pasture abandonment, respectively), and in a 35-year-old exotic cypress tree plantation, in the oriental Central Valley, in Orosí, Costa Rica. Standard diversity, similarity indexes, and the importance value index were calculated. An NMDS analysis was performed on the community structure parameters and in a presence-absence matrix. Results: We found 64 lichen species in 25 families with 42, 21, and 23 species, and 20, 10, and 15 families, in the young and old secondary forests, and the cypress plantation, respectively. Cryptothecia sp. possessed the highest importance across sites. More than 87 % of the species are rare. The combined IVI of the top three families were: 36, 48.5, and 74.8 % in the young and old forests and the Cypress plantation sites, respectively. Overall, Arthoniaceae is in the top three families. The young forest had the highest species richness, but the old forest presented the best evenness. Similarity and diversity indexes suggest a particularly low resemblance in the lichen communities but a smooth gradient differentiation between the three forests, which was confirmed by the NMDS test. The homogeneity test identified great differences in ecological importance and composition. Conclusions: This region contains a distinctive assemblage of species resulting in a strong community differentiation by site, reflecting the influence of ecophysiological and microclimatic factors that define lichen establishment and survival and suggesting a great regional beta diversity, within a fragmented landscape. Greater connectivity and passive restoration strategies resulted in greater diversity and a more heterogeneous community structure on both forests than the corticolous community of the abandoned plantation. Protection of forest fragments will maximize the integrity of future forests.
Resumen Introducción: La diversidad de líquenes, la estructura y composición de la comunidad y la abundancia de algunas especies y familias se ha usado como indicadores de la salud y continuidad ecológica de los ecosistemas boscosos tropicales. Objetivos: Evaluar la composición, diversidad e importancia ecológica de las especies de líquenes en tres ecosistemas boscosos que difieren en el tiempo regeneración natural, como indicadores de la influencia de la restauración pasiva en el ensamble de la comunidad de líquenes cortícolas. Métodos: Se midieron los líquenes individuales sobre los troncos de árboles en un bosque secundario avanzado (OF), en un bosque secundario joven (YF, con 50 y 14 años de regeneración natural tras abandono del potrero, respectivamente), y en una plantación abandonada de ciprés exótico con 35 años de edad (CP), en la región oriental del Valle Central de Costa Rica. Se calcularon los índices estándares de diversidad, similitud y valor de importancia (IVI), además de un análisis de NMDS sobre los parámetros de la estructura de la comunidad en una matriz de presencia-ausencia. Resultados: Encontramos 64 especies en 25 familias, con 42, 23 y 21 especies y 20, 10 y 15 familias en los sitios YF, CP y OF, respectivamente. Una especie de Cryptothecia sp. presentó el IVI más alto en los tres bosques. Más del 87 % de las especies son raras. El IVI combinado de las tres familias más importantes fue: 36, 48.5 y 74.8 % en los sitios: YF, OF y CP, respectivamente. Arthoniaceae está entre las tres familias más importantes en los tres sitios. El YF es el sitio con más especies, pero el sitio OF presentó la mayor igualdad. Los índices de similitud y diversidad sugieren una semejanza particularmente baja entre las comunidades liquénicas, pero separadas por una gradiente de diferenciación difusa entre los tres sitios, lo cual es confirmado por el análisis NMDS. La prueba de homogeneidad confirmó grandes diferencias en la importancia ecológica y la composición. Conclusiones: La región contiene un ensamblaje propio de especies que resulta en una fuerte diferenciación comunitaria entre bosques, reflejo de la influencia de factores ecofisiológicos y microclimáticos en el establecimiento y supervivencia de líquenes; lo que sugiere una gran diversidad beta regional, en un paisaje fragmentado. Una mayor conectividad y estrategias de restauración pasiva dieron como resultado una mayor diversidad y una estructura comunitaria más heterogénea en ambos bosques que la comunidad cortícola de la plantación exótica abandonada. La protección de fragmentos forestales maximizará la integridad de los bosques futuros.
Subject(s)
Tropical Ecosystem , Lichens , Costa RicaABSTRACT
Resumen Se presentan los resultados de las evaluaciones de la liquenobiota saxícola del nevado Pastoruri (Cordillera Blanca, departamento de Áncash) realizadas en los meses de septiembre de los años 2011 y 2012. La composición de la liquenobiota fue de 28 especies, agrupados en 19 géneros y 14 familias. Las familias Lecanoraceae, Parmeliaceae y Teloschistaceae presentaron el mayor número de géneros, mientras que los géneros Buellia, Lecanora y Umbilicaria registraron mayor riqueza de especies. Los líquenes de biotipo crustáceos fueron los dominantes (61% del total), seguido por los foliosos (32%) y fruticosos (7%).
Abstract The saxicolous lichens from Nevado Pastoruri (Cordillera Blanca, Department of Áncash) was evaluated at September month of years 2011 and 2012. We found 28 species, grouped into 19 genera and 14 families. The Families Lecanoraceae, Parmeliaceae and Teloschistaceae presented the greatest number of genera, while the genera Buellia, Lecanora and Umbilicaria recorded higher species richness. Crustacean lichens were dominant (61% of the total), followed by foliose (32%) and fruticose (7%).
ABSTRACT
Abstract Lichens are traditionally divided into types such as "crustose", "foliose" and "fruticose", with different shapes and heights. Substrate, temperature and water are thought to affect lichen height, but there are few studies regarding tropical paramo lichens. Along 2015 I measured those variables in the terricolous lichens of the Cerro Buena Vista, paramo (Costa Rica, 9°33' N & 83°45' W). The measurements were taken inside the lichens and in the substrate under them, in 61 randomly located quadrats (50 x 50 cm). Lichens grew taller on (1) warmer ground, (2) wetter ground, (3) the moister Caribbean slope, and (4) the season with heavier rainfall, as expected. Apparently, atmospheric factors are more important than substrate in the determination of temperature, relative humidity and growth of lichens. Physiologically available water seems to be the main determinant of lichen vertical growth in the Buena Vista paramo.(AU)
Resumen Los líquenes se dividen tradicionalmente en morfotipos como "crustoso", "folioso" y "fruticoso", con diferentes formas y alturas. Se cree que el sustrato, la temperatura y el agua afectan la altura de los líquenes, pero existen pocos estudios con respecto a los líquenes tropicales. A lo largo del 2015, medí esas variables en los líquenes del suelo en el páramo de Cerro Buena Vista (Costa Rica, 9 ° 33'N; 83 ° 45'W). Las medidas se tomaron dentro de los líquenes y en el sustrato debajo de ellos, en 61 cuadrantes ubicados al azar (50 x 50 cm). Los líquenes fueron más altos en (1) suelo más cálido, (2) suelo más húmedo, (3) la pendiente del Caribe, que es más húmeda y (4) la temporada con lluvias más intensas, como se esperaba. Aparentemente, los factores atmosféricos son más importantes que el sustrato en la determinación de la temperatura, la humedad relativa y el crecimiento de los líquenes. El agua fisiológicamente disponible parece ser el principal determinante del crecimiento vertical de los líquenes en el páramo del Cerro Buena Vista.(AU)
Subject(s)
Tropical Climate , Tropical Ecosystem , Physical Phenomena , Lichens/growth & development , Costa RicaABSTRACT
Resumen:La fragmentación de los ecosistemas es uno de los fenómenos antrópicos de mayor impacto global, y el efecto borde provoca que solo el interior de los fragmentos conserve sus características bióticas y abióticas originales. Los líquenes son organismos especialmente susceptibles a la variabilidad ambiental, lo que podría ser útil para la bio-indicación del efecto borde. En este trabajo se evaluó el efecto borde en dos fragmentos de Polylepis quadrijuga en el Páramo de la Rusia (Boyacá-Colombia), para determinar si existe un efecto borde sobre la distribución de los líquenes asociados a P. quadrijuga y su contenido de clorofilas. Se utilizaron tres transectos de 70 m a través del gradiente matriz-borde-interior en cada fragmento. Se escogieron nueve forofitos por transecto para medir variables ambientales: radiación fotosintéticamente activa, humedad relativa y temperatura del aire, y variables biológicas: riqueza y cobertura de cada especie. Además, fueron elegidas las especies que estaban presentes en las tres zonas del gradiente para cuantificar el contenido de clorofilas a y b, y determinar si hay cambios en la relación de clorofilas a/b que podrían sugerir plasticidad fisiológica como respuesta al efecto borde. Nuestros resultados mostraron que el fragmento 2 tenía una mayor exposición al borde debido a su alta relación perímetro/área, lo que causa una homogenización ambiental y pérdida de biodiversidad con relación con el fragmento 1. En general, se encontraron 55 especies que se distribuyen diferencialmente en relación con los fragmentos y el gradiente matriz-borde-interior. El interior del fragmento 1 fue la zona más conservada, que alberga una composición diferente en más de un 40 % a la composición de cualquier otra zona. Se clasificaron los líquenes de acuerdo con sus hábitos: gelatinosos, fruticosos, costrosos o foliosos, pero no se encontró ninguna relación entre la distribución por hábito y el efecto borde. Seis especies de amplia distribución mostraron cambios en el contenido de clorofila a lo largo del gradiente matriz-borde-interior, lo que es una evidencia de la plasticidad fisiológica al efecto borde. También fue posible diferenciar entre especies con preferencia por ambientes de alta temperatura y especies con preferencia a lugares más húmedos y suficientemente irradiados. Se concluye que algunas especies podrían tener un importante potencial como bio-indicadores de la fragmentación en ambientes de páramo.
Abstract:The ecosystems fragmentation is one of the anthropic phenomena with highest impact at global level and the edge effect causes that only the interior of fragments conserves their original biotic and abiotic characteristics. Lichens are organisms especially susceptible to environmental variability, what could be useful for bio-indication of edge effect. In this work, we evaluated the edge effect in two fragments of Polylepis quadrijuga in the Páramo de la Rusia (Boyacá-Colombia) to determine if there is an edge effect on distribution of lichens associated to P. quadrijuga and their chlorophyll content. We used three transects of 70 m across the matrix-edge-interior gradient in each fragment. We chose nine phorophytes per transect to measure the environmental variables: photosynthetically active radiation, relative humidity and air temperature, and the biological variables: richness and cover per species. Besides, we employed the species that were present in all the three zones of the gradient to quantify the content of chlorophylls a and b, and determine if there are changes in the ratio of chlorophylls a/b that could suggest physiological plasticity as a response to the edge effect. Our results showed that fragment 2 had a higher edge exposition because of its high relation perimeter/area, allowing to an environmental homogenization and lose of biodiversity in relation with fragment 1. Overall, we found 55 differentially distributed species in relation with the fragments and the matrix-edge-interior gradient. The interior of fragment 1 was the most conserved zone, harboring a composition different in more than 40 % to the composition of any other zone. We classified the lichens according with their habits: gelatinous, fruticose, crusty or foliose, but we did not find any relationship between the habit distribution and the edge effect. Six species of wide distribution showed changes in the chlorophyll content along the matrix- edge-interior gradient, what is an evidence of physiological plasticity to edge effect. It was also possible to distinguish between species with preference to warmer environment and species with preference to more humid and sufficiently irradiated places. We concluded that some species of lichens could have an important potential as bio-indicators of fragmentation in the páramo. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1683-1697. Epub 2016 December 01.
Subject(s)
Chlorophyll/analysis , Rosaceae/chemistry , Lichens/chemistry , Solar Energy , Species Specificity , Temperature , Chlorophyll/physiology , Analysis of Variance , Colombia , Rosaceae/physiology , BiodiversityABSTRACT
El incremento en las sustancias tóxicas a la atmósfera en la ciudad de Guatemala ha generado un empeoramiento paulatino de la calidad del aire. Por lo tanto, es necesaria la incorporación de un sistema de monitoreo que sea económico y que permita determinar las áreas de la ciudad con altos índices de contaminación aérea, para posteriormente tomar medidas adecuadas para su mitigación. En este sentido, el presente estudio categorizó los niveles de contaminación aérea por medio del Índice de Pureza Atmosférica (IPA), complementado con coberturas de cada especie, el Factor de Clasificación Ambiental (ECF) y el cambio en la diversidad de líquenes en árboles de jacaranda en 32 puntos del corredor metropolitano en la ciudad de Guatemala. Los resultados reportan 16 familias, 23 géneros y 65 especies de líquenes, de las cuales 26 son nuevos registros para el país y 5 para la ciudad. Los valores de IPA variaron de 4.5 a 25.5 indicando homogeneidad en los índices de contaminación aérea a lo largo del corredor metropolitano. En los puntos P5 Instituto Normal para Señoritas Centro América (INCA) y P13 (Parroquia Santa Marta) se obtuvieron los menores valores de IPA por lo que son los puntos con mayor grado de contaminación aérea; y los puntos P28 (Universidad Francisco Marroquín) y P21 (Avenida las Américas 1) obtuvieron los mayores siendo las áreas menos contaminadas. La incorporación del valor de cobertura al IPA, permite categorizar las áreas a una escala más fina, dándole mayor peso a especies toxitolerantes y toxisensibles. Estos resultados evidencian que los líquenes pueden complementar mediciones físicoquímicas de contaminación aérea, especialmente en puntos en donde no se cuenta con equipo para ello y pueden indicar lugares con problemas ambientales que necesiten investigación instrumental, como los puntos P5 y P13. Así mismo, se proponen 10 especies foliosas de líquenes para ser utilizadas como indicadoras de contaminación aérea en futuras investigaciones. Palabras clave: Líquenes, Índice de Pureza Atmonsférica, Factor de Clasificación Ambiental, bioindicador,
The increase of toxic substances into the atmosphere in Guatemala City has led to a progressive deterioration of the air quality. Therefore, it is necessary to incorporate an economic monitoring system that is able to identify the areas of the city with the highest levels of air pollution, and after that, be able to take the appropriate mitigation measures according to it. In this regard, this study categorized the levels of air pollution through the Index of Atmospheric Purity (IAP) complemented with coverage of each specie, the Environmental Classification Factor (ECF) and the change in diversity of lichens on Jacaranda trees in 32 points of metropolitan corridor of Guatemala City. The result reports 16 families, 23 genera and 65 species of lichens, whose 26 are new records for the country, and 5 for the city. IAP rate varied from 4.5 to 25.5, indicating that the metropolitan corridor is homogeneous regarding to high levels of air pollution. In points P5 (INCA) and P13 (Parish Church Parroquia Santa Marta) the lower rate of IAP were found, meaning that these are the points with the higher degree of air pollution; and points P28 (Marroquín University) and P21 (Avenida las Americas 1) obtained the highest degree, being the least polluted areas. The incorporation of the value of coverage to the IAP allows categorizing areas at a finer scale, giving more importance to toxitolerant and toxisensitive species. These results demonstrate that lichens can complement physical-chemical measurements of air pollution, especially in places where there is no equipment for it and it and therefore could indicate places with environmental problems that may need instrumental research, such as points P5 and P13. Furthermore, 10 micro lichen species are proposed to be used as air pollution indicators in future researches.
Subject(s)
Environmental Health , Lichens , Air Pollution , GuatemalaABSTRACT
Los líquenes (hongos liquenizados) son organismos que presentan una alta diversidad, especialmente en las regiones tropicales; sin embargo, en Perú su conocimiento aún es escaso. Utilizando una metodología convencional, así como literatura actualizada sobre la descripción de géneros y especies, se presenta una lista de los macro-líquenes presentes en el Santuario Histórico de Machu Picchu (Cusco, Perú). Se reportan 67 especies de macro-líquenes, 9 de los cuales son nuevos registros para el Perú. Las familias Parmeliaceae, Physiciaceae y Lobariaceae son las que presentan mayor riqueza de especies en el área de estudio.
While high species diversity of lichen - lichenized fungi - is reported especially in the tropics, the studies on these organisms are still scarce in Peru. Using conventional methodology and current literature on the description of genera and species, we reported macro-lichens collected from Historic Sanctuary of Machu Picchu (Cusco, Peru). Sixty seven species of macro-lichens are reported to SHMP, nine new records to Peru are documented. Parmeliaceae, Physciaceae and Lobariaceae are the families with major number of species.
ABSTRACT
Objetivo. Determinar la actividad antimicrobiana de extractos de diferentes polaridades de las especies de Everniastrum columbiense, Flavopunctelia flaventor, Parmotrema simulans, Ramalina celastri, Teloschistes exilis y Usnea sp., recolectadas en el margen occidental de la cuenca alta del Río Bogotá, a los 05° 07' 23,4"N y 73° 39' 10,5"W; frente a los microorganismos Staphylococcus aureus y Klebsiella pneumoniae. Materiales y métodos. Se utilizó el método de difusión en gel por perforación en placa. Resultados. Los extractos de Flavopunctelia flaventor, Everniastrum columbiense, Parmotrema simulans, Usnea Sp y Ramalina celastri, presentaron actividad antibacteriana frente a Staphylococcus aureus. Y los extractos de Flavopunctelia flaventor, Usnea Sp. y Ramalina celastri, presentaron actividad antibacteriana frente a Klebsiella pneumoniae.
To determine the antimicrobial activity of extracts of different polarities species Everniastrum columbiense, flaventor Flavopunctelia, Parmotrema simulans, Ramalina celastri, Teloschistes exilis and Usnea sp, collected on the western margin of the basin alta of Río Bogotá, to 05. ° 07 '23.4 "N and 73 ° 39' 10.5" W; against microorganisms Staphylococcus aureus and Klebsiella pneumoniae. Materials and methods. Diffusion method was used in gel plate by drilling. Results: Extracts of Flavopunctelia flaventor, Everniastrum columbiense, Parmotrema simulans, Usnea Sp and Ramalina celastri showed antibacterial activity against Staphylococcus aureus with antibacterial. And extracts Flavopunctelia flaventor, Usnea Sp and Ramalina celastri showed antibacterial activity against Klebsiella pneumoniae.
Subject(s)
Humans , Botany , Fungi , Lichens , Anti-Infective AgentsABSTRACT
Background: Invariant natural killer T cells (iNKT) can be activated by certain types of glycolipids that have the potential to generate adjuvant effects which could be used to develop effective and safe immunotherapies. Many of these glycolipids have been isolated from natural organisms, but there is a great amount of these organisms completely unexplored as a source of these types of compounds. Some of these organisms are lichens which are complex symbiotic organisms that have been showed to contain glycolipids. Objectives: We decide to test if glycolipids isolated from lichens would be able to activate iNKT cells in vitro and in vivo. Methods: We have used extracted glycolipids from 43 different species of lichens from Colombia. We have used iNKT hybridoma cells, C57BL/6 mice, IL-2 ELISA and the B16 melanoma to test for the adjuvant capabilities of glycolipids isolated from lichens. Results: In this study we have found two glycolipids with the capacity to activate iNKT cells in vivo. One of the glycolipids was able to activate iNKT cells in vivo, and was competent to induce protection against the B16 melanoma in the mouse model. Conclusions: We propose a possible chemical structure for a novel glycolipid called ß-GalCer-lich (1) derived from the lichen Stereocaulon ramulosum.
Antecedentes: Las células asesinas naturales T (iNKT) pueden ser activadas por ciertos tipos de glicolípidos que tienen el potencial para generar efectos adyuvantes los cuales pueden ser usados para desarrollar inmunoterapias efectivas. Muchos de estos glicolípidos han sido aislados de organismos naturales, pero hay una gran cantidad de organismos completamente inexplorados como fuente de este tipo de compuestos. Algunos de estos organismos son los líquenes, los cuales son organismos simbiontes complejos para los que se ha mostrado que contienen glicolípidos. Objetivos: Nosotros decidimos probar si los glicolípidos aislados de líquenes podrían ser capaces de activar alas celulas iNKT in vitro e in vivo. Metodos: Nosotros hemos extraído glicolípidos de 43 especies de líquenes de Colombia. Nosotros hemos usado células de un hibridoma de iNKTs, ratones C57BL/6, ELISA para IL-2 y el melanoma B16 para probar la capacidad adyuvante de los glicolipidos aislados de los líquenes. Resultados: En este estudio nosotros hemos encontrado dos glicolípidos con la capacidad de activar iNKTs in vitro. Uno de los glicolípidos fue capaz de activar células iNKT in vivo, y fue competente para inducir protección contra el melanoma B16 en el modelo de ratón. Conclusiones: Nosotros proponemos una posible estructura química para el nuevo glicolípido llamado ß-GalCer-lich (1) derivado del liquen Stereocaulon ramulosum.
Subject(s)
Humans , Killer Cells, Natural , Glycolipids , Adjuvants, Immunologic , LichensABSTRACT
Los líquenes son los hongos que establecen una relación simbiótica con un alga o cianobacteria. En esta simbiosis se producen por parte del hongo, una serie de metabolitos secundarios conocidos como sustancias liquénicas; las cuales presentan una marcada actividad antibiótica. En Cuba no se tienen antecedentes sobre estudios de metabolitos liquénicos por lo que se propone; evaluar el efecto fungicida de extractos liquénicos producidos por especies cubanas así como identificar sus metabolitos. Se emplearon líquenes de diferentes zonas del país (Parmotrema dilatatum, P. tinctorum, P. praesorediosum P. cristiferum, Ramalina americana, Cladonia ceratophylla y Cladonia portentosa spp. pacífica), a los cuales se les extrajo con acetona, las sustancias liquénicas almacenadas en el talo. Los extractos fueron probados contra los hongos fitopatógenos Rhizoctonia solani y Phythophtora nicotianae; por el método de envenenamiento del medio de cultivo agar papa dextrosa a concentraciones de: 0,01 por ciento; 0,03 por ciento y 0,07 por ciento. Se utilizó un control negativo de dimetilsufóxido al 0,07 por ciento y se determinaron los porcentajes de inhibición, cuyos resultados fueron analizados estadísticamente. Los metabolitos secundarios presentes en los extractos se identificaron por cromatografía de capa fina (TLC). Exceptuando el extracto liquénico de P. cristiferum, todos los demás mostraron más de un 50 por ciento de inhibición del crecimiento de ambos hongos a la concentración de 0,07 por ciento, mientras que a las restantes concentraciones los valores fueron variados con diferencias significativas con respecto al control. Se lograron identificar tres metabolitos liquénicos: metil 2-O- metilmicrofilinato, 4-O-Demetilmicrofilinico y el ácido ramaniloico.
Lichens are fungi that establish a symbiotic relationship with an alga or cyanobacterium. This symbiosis produced by the fungus, a series of secondary metabolites known as lichen substances; which show a strong antibiotic activity. In Cuba there is no background on the studies above lichen metabolites so it is proposed; evaluate the fungicidal activity of lichen extracts produced by Cuban species and to identify metabolites. Lichens from different areas of the country (Parmotrema dilatatum, P. tinctorum, P.praesorediosum, P. cristiferum, Ramalina americana, Cladonia ceratophylla and Cladonia portentosa spp. pacífica), to which it extracted with acetone, the lichen substances stored in tallus. The extracts were tested against the fungal pathogens Rhizoctonia solani and Phythophtora nicotianae; poisoning by the method of culture medium potato dextrose agar at concentrations of 0.01 percent; 0.03 percent and 0.07 percent. A negative control to 0.07 percent dimethylsulfoxide was used and the percentage of inhibition, the results were analyzed statistically determined. Secondary metabolites present in the extracts were identified by thin layer chromatography (TLC). Except P. cristiferum lichen extract, all others showed more than 50 percent growth inhibition of both fungi at concentration of 0.07 percent, while the remaining concentrations were varied values with significant differences from the control. Was made to identify three lichen metabolites metilmicrofilinato 2 methyl-O, 4-ODemetilmicrofilinico and ramaniloico acid.
Subject(s)
Antigens, Fungal/isolation & purification , Antigens, Fungal/analysis , Lichens/metabolism , Lichens/chemistry , Acetone , Agar , Antifungal Agents , Cuba , Culture Media , Chromatography, Agarose/methods , Fungi/pathogenicity , PoisoningABSTRACT
Objetivo: determinar la distribución y el estado de los rodales de manglar en Arroyo de Plata (Departamento de Bolívar). Metodología: se realizaron labores de campo a través del arbolado, mediante el muestreo biológico de la flora y de los parámetros físicos y químicos del agua y de los suelos a lo largo de transectos dentro del bosque. Resultados: la composición del rodal incluye cinco especies, Rhizophora mangle (mangle rojo, colorao o colorado), Avicennia germinans (mangle salado, prieto, negro o iguanero), Laguncularia racemosa (mangle blanco, amarillo o bobo), Conocarpus erecta (mangle zaragoza) y Pelliciera rhizophorae (mangle piñuelo). Asociado a la especie pionera (R. mangle) se encontró el líquen (Peltigera sp.), cuya relación se lleva a cabo solo cuando el mangle está en estado de degradación y los parámetros fisicoquímicos de las aguas y los suelos, son extremos. Conclusión: Los manglares mostraron características mixtas, tipo maduro ribereño y de cuenca, donde la especie invasora P. rhizophorae presenta el mayor IVI, debido a su alta densidad. El registro de los líquenes Peltigera sp. y su presencia en los manglares del Caribe colombiano no solo es el primero para esta Región, su distribución puede estar restringida a la zona costera, es incidental, y demuestra su gran capacidad de adaptación a los cambios ambientales, y puede ser considerada entre los en bio-indicadores de las características ambientales, especialmente de las alteraciones actuales de los suelos y las aguas.
Objective: To determine the distribution and status of mangrove stands in Arroyo de Plata (Department of Bolívar). Methodology: Field work was conducted through woodland, using biological sampling of the flora and the physical and chemical parameters of water and soil along transects within the forest. Results: The composition of the stand includes five species, Rhizophoramangle (red, colorao or colorado mangrove), Avicenniagerminans (salty, dark color, black or iguanero mangle) Laguncularia racemosa (white, yellow or bobo mangrove), Conocarpus erecta (zaragoza mangle) and Pelliciera rhizophorae (tea mangrove). The lichen (Peltigera sp), was found associated with the pioneer species (R. mangrove) whose relationship is carried out only when the mangrove is in a state of degradation and the physical-chemical parameters of water and soil, are extreme. Conclusion: Mangroves showed mature coastal basin type mixed characteristics, where the invasive species P. rhizophorae has the highest IVI due to its high density. Registration of Peltigera sp lichens and its presence of the Colombian Caribbean mangrove is not only the first for this region, its distribution may be restricted to the coastal zone, it is incidental and demonstrates its ability to adapt to environmental changes, and can be considered between the bio-indicators of environmental characteristics, especially of the the current alterations of soil and water.
Subject(s)
Humans , Lichens , Caribbean Region , Rhizophoraceae , WetlandsABSTRACT
Los líquenes y briófitos son organismos útiles en la determinación de la calidad del aire. En la ciudad de Tunja (departamento de Boyacá, Colombia), es evidente la escasez de zonas verdes por el aumento en las construcciones, lo que contribuye al detrimento de la pureza atmosférica y trae consigo el deterioro de la salud de la ciudadanía y la reducción de los hábitats y poblaciones de las plantas criptógamas. Mediante la determinación del índice de Pureza Atmosférica (IPA) se identificaron las zonas con mayor influencia de contaminantes del aire. Parmotrema austrosinense corresponde a la especie más frecuencia; y la estación de la Normal Femenina, con IPA de 52,2196 es influenciada por los contaminantes atmosféricos; las estaciones de los Parques Santander y Semáforos son las más contaminadas (IPA 8,5333) con solo dos especies (Heterodermia albicans y Lobariaceae sp.). Se destaca la evaluación en la Reserva Forestal Protectora El Malmo con un IPA de 34,0281 y 23 especies. Los valores de IPA se agruparon en zonas de isocontaminación para ser representados cartográficamente. El uso de organismos bioindicadores es una estrategia natural y económica que permite zonificar las urbes y enfocar planes para revegetalización de ciudades, generando la disminución del impacto de contaminantes en el aire con el fin de mejorar la calidad de vida de los pobladores.
Lichens and bryophytes are useful organisms in air quality determination. In the city of Tunja (Boyacá, Colombia), is evident the lack of green areas by the increase of building, which contributes to the detriment of the atmospheric purity making unhealthy conditions to the citizens and habitats and population reduction of cryptogamic plants. Using the Index of Atmospheric Purity (IAP) we identified the greater influence air pollutants areas. Parmotrema austrosinense has the highest frequency; and the Normal Femenina station with an IAP of 52,2196 is an atmospheric pollutants influenced area; Parque Santander and Semáforos, are the most contaminated (IAP 8,5333) with only two species (Heterodermia albicans and Lobariaceae sp.). We highlight the evaluation in the Reserva Forestal Protectora El Malmo with an IAP of 34,0281 and 23 species. IAP values were grouped in isocontamination areas to be represented cartographically. The use of bioindicators organisms is a natural and economic strategy allowing us to mapping urban areas and make revegetation cities designs, generating the contaminants diminution air impact improving the citizen's life quality.
ABSTRACT
Malpelo Island is located 380km off the mainland continental coast of Colombia, in the Pacific Ocean. Several geological, ecological, and zoological studies, both marine and terrestrial, have been conducted in this island. Despite some marginal comments on some publications, no single specific survey has been devoted to botany so far. In order to make a floristic inventory of the terrestrial flora of this island, three field trips were made in 2010 to collect vascular plants, mosses, and lichens, as well as data on their distribution within the island. We collected and identified 25 species of lichens, two species of vascular plants and one moss. Lichens were the most diverse group found, including records of four new genera (Endocarpon, Fuscidea, Lecanographa and Verrucaria) and 13 new species for Colombia. The high lichen richness on Malpelo might be explained by their efficient form of asexual reproduction (soredia and isidia), that may have facilitated their transport to the island by migrating birds or wind. Once on the island, it is possible that lichens persist by being chemically protected against herbivores. The great number of new generic and species records for Colombia is explained by the low number of studies in saxicolous lichens conducted so far in the country, particularly on coastal areas and remote islands. Only two species of vascular plants were collected, a grass, Paspalum sp., and a fern, Pityrogramma calomelanos, and both of them correspond to new determinations for Malpelo. A moss species previously reported but with no positive identification was collected and identified as Octoblepharum albidum. Other species previously reported, for example, some species of shrubs, were not observed. The low number of vascular plants is probably due to a combination of soil conditions and herbivory by land crabs. This study is the first complete inventory of the flora of Malpelo and is a starting and reference point for future comparisons among islands in the Eastern Tropical Pacific. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 327-336. Epub 2014 March 01.
La isla Malpelo se encuentra en el Pacífico colombiano, a unos 380km de la costa continental. La Isla ha sido objeto de algunos estudios geológicos, ecológicos y faunísticos, tanto marinos como terrestres, pero ningún estudio estrictamente botánico. Con el fin de realizar un inventario de la flora terrestre de Malpelo, se realizaron tres salidas de campo durante el 2010, en las que se recolectaron plantas vasculares, musgos y líquenes, y se tomaron datos sobre su distribución en la Isla. El grupo más diverso correspondió a los líquenes, con 25 especies, incluidos cuatro nuevos géneros para Colombia, Endocarpon, Fuscidea, Lecanographa y Verrucaria, y 15 nuevos registros de especies para Colombia. La alta riqueza de especies de líquenes en la Isla puede deberse a la forma de reproducción asexual de estos organismos, que pudieron haber sido transportados hasta Malpelo por aves migratorias o por viento; además, pueden estar protegidos químicamente de la herbivoría por cangrejos terrestres. La gran cantidad de registros nuevos para Colombia se explica por la poca cantidad de trabajos en líquenes saxícolas en el país, sobre todo en zonas costeras e insulares. Solo se registraron dos especies de plantas vasculares, una gramínea, Paspalum sp., y un helecho, Pityrogramma calomelanos. También se recolectó una especie de musgo, Octoblepharum albidum. La escasez de plantas vasculares probablemente se deba a la combinación de condiciones de los suelos y a la herbivoría por cangrejos terrestres. El presente estudio es el primero en darle relevancia a la flora terrestre de Malpelo y constituye un punto de referencia y comparación para estudios semejantes en otras islas del Pacífico Oriental Tropical.
Subject(s)
Animals , Ecosystem , Plants/classification , Colombia , Lichens , Pacific Islands , Pacific OceanABSTRACT
Phorophyte specificity and microenvironmental preferences of corticolous lichens in five phorophyte species from premontane forest of Finca Zíngara, Cali, Colombia). Lichenized fungi or lichens are organisms that have been little studied in the tropics and which distribution is affected by microenvironmental factors and substrate characteristics. The present study aimed to identify phorophyte specificity and microenvironmental preferences of corticolous lichens in five phorophyte species from premontane forest of the farm Finca Zingara in Cali, Colombia. For this, five individuals were selected from five tree species (phorophytes). Lichen species present in a 0.50x0.20m² quadrant located in the trunk of each tree at a height of 1.3m were identified. Substrate parameters such as bark pH, Diameter Breast Height (DBH) and bark structure were measured. Also, microenvironmental factors including temperature, humidity and irradiance were determined. In order to detect phorophyte preferences, a non-metric multidimensional scaling (NMS) and indicator species analysis were made. Spearman correlation analysis was used to assert the relationship between environmental variables and groupings found in the NMS. A total of 69 species of lichens were found, of which 37 were identified to species, 18 to genera and 14 were not determined because they were sterile or had no spores. NMS showed that some individuals of the same tree species were grouped alongside the analysis dimensions, and they were related with the factors of light intensity, temperature and DBH. Only three lichens with preference for certain tree species were found (Arthonia microsperma by Meriania sp., Cladonia ceratophylla and sorediado 8 by Clusia sp.), suggesting absence of phorophyte preferences. Thus, it can be concluded that lichens from the study area do not show phorophyte preference, but their distribution is affected by light, temperature and DBH. Rev. Biol. Trop. 60 (2): 843-856. Epub 2012 June 01.
El objetivo de este trabajo fue evaluar la especificidad de forófito y las preferencias microambientales de los líquenes cortícolas en el Bosque de la Finca Zíngara (Cali, Colombia). Asimismo, se seleccionaron cinco individuos de cinco especies de árboles. Además, se identificaron las especies de líquenes presentes en un cuadrante de 0.50x0.20m2 ubicado en el tronco de cada árbol a 1.3 m de altura. También, se midieron parámetros microambientales como pH de la corteza, diámetro a la altura del pecho (DAP), estructura de la corteza, humedad relativa e irradianza. Para detectar las preferencias de forófito, se realizó un escalamiento no métrico multidimensional (NMS) y un análisis de especies indicadoras. Luego se efectúo un análisis de correlación de Spearman para evaluar la relación entre las variables ambientales y los agrupamientos encontrados en el NMS. Se encontraron 69 especies de líquenes, de los cuales 37 fueron determinados hasta especie, 18 hasta género y 14 no fueron determinados. El resultado del NMS mostró que algunos individuos de la misma especie de árbol se agruparon a lo largo de las dimensiones del análisis, y están relacionados con los factores intensidad de luz, temperatura y DAP. Sólo tres especies mostraron preferencia por ciertas especies de árboles (Arthonia microsperma por Meriania sp., Cladonia ceratophylla y sorediado 8 por Clusia sp.), lo cual sugiere ausencia de preferencias de forófito.
Subject(s)
Ecosystem , Lichens/physiology , Trees , Colombia , Lichens/classificationABSTRACT
RESUMEN Para evaluar la calidad del aire en La Habana se utilizó como bioindicador una especie de liquen epífi to (physcia alba sp.) que crece sobre Palma real (Roystonea regia). Se colectó un total de 225 muestras de líquenes en 181 sitios seleccionados de acuerdo con las condiciones de contaminación por tráfi co y actividades industriales. Se determinaron las concentraciones de 15 elementos (Na, Mg, Al, Ca, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Sr, Cd and Pb), empleando espectrofotometría de absorción atómica, fluorescencia de rayos X por refl exión total y voltametría de redisolución anódica. Se aplicaron métodos estadísticos (componentes principales) a los resultados analíticos y se obtuvieron y seleccionaron varios factores. Por último se presentan mapas con los perfiles de distribución elementales y de factores y su posible correlación con distintas fuentes de contaminación.
ABSTRACT An epiphytic lichen (physcia alba sp.) grown over Royal Palm (Roystonea regia) tree was used as bioindicator of air quality in Havana City. A total of 225 lichen samples were collected in 181 selected sites according to traffic and industrial conditions. The concentrations of 15 elements (Na, Mg, Al, Ca, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Sr, Cd and Pb) were determined by Atomic Absorption Spectrophotometry, Total Reflection X-Ray Fluorescence and Anodic Stripping Voltammetry. Principal Component Analysis was applied to analytical results and some factors were obtained. Finally, maps with lichen elemental contents and factors’ patterns are presented. Several possible pollution sources were identified.
ABSTRACT
La distribución y el crecimiento de los líquenes están condicionados por diferentes factores ambientales, entre estos la variación en gradientes altitudinales. En la cordillera Oriental de los Andes de Colombia, no se han realizado estudios sobre zonación altitudinal de líquenes. En este trabajo se estudiaron las variaciones en la estructura de la comunidad de líquenes epifitos en un gradiente altitudinal (2.000- 2.600 m) en el PNN Tatamá. Se encontró que con el aumento en altura hay una disminución en riqueza y diversidad, siendo esto una desviación del patrón encontrado generalmente en otros trabajos sobre líquenes y gradientes altitudinales. La comunidad a bajas alturas se compone principalmente de líquenes fruticosos (cobertura de 30% a 2.070 m y 0% a 2.560 m) y a mayores alturas de líquenes foliosos (cobertura de 15% a 2.070 m y 43% a 2.560 m). La altura, además de influenciar la estructura de la comunidad de los líquenes, puede afectar el desarrollo y la morfología de estos. En el género folioso Sticta se presentaron variaciones intraespecificas en la densidad de cifelas (órganos de intercambio gaseoso) asociadas a la altura, encontrándose un efecto significativo de la altura sobre la densidad de cifelas en las especies S. andensis y S. gyalocarpa (ANOVA, valor p= 0.008 y 0.05 respectivamente). Esto muestra un mecanismo de adaptación a los cambios ambientales que se dan con la altura.
Lichens growth and distribution are conditioned by various environemental factors, altitude being an important one. In the Cordillera Oriental of Colombian Andes, there havent been studies on lichens altitudinal zonation. We studied the variation on lichen community structure along an altitudinal gradient (2000- 2600 m) in PNN Tatamá, we found diversity diminishes as altitude increases, this being a variation from whats generally found in lichen community behavior. At low altitudes, the community was conformed by fruticose lichens (30% cover at 2070 m and 0% at 2560 m), and by foliose lichens at high altitudes (15% cover at 2070 m and 43% at 2560 m). Altitude, besides influencing lichens community structure, may affect their development and morphology. In the foliose genus Sticta we found intraspecific variation on cyphellae (gaseous exchange organs) density associated with altitude, a significant effect of altitude on cyphellae density was found for the species S. andensis and S. gyalocarpa (ANOVA p value= 0.008 and 0.05 respectively). This shows an adaptation mechanism of these organisms to the environmental changes given with altitude.
ABSTRACT
El presente trabajo informa los resultados del estudio de la liquenobiota de la localidad andina de Pueblo Libre, (09º05'30'' - 09º10'15'' S y 77º47'30'' - 77º52'50'' W) en Huaylas, Ancash, Perú. Las colectas se realizaron desde los 2200 hasta los 4450 m de altitud. El presente trabajo da a conocer 38 especies, agrupadas en 29 géneros y 17 familias y además del grupo imperfecto. Se presentan claves para familias, géneros y especies. Para cada especie se presenta una descripción macroscópica y microscópica y de reacción química, asimismo se menciona el hábitat y material examinado.
In this paper we report the lichens of Pueblo Libre, an Andean locality, (09º05'30'' - 09º10'15'' S and 77º47'30'' - 77º52'50'' W) in Huaylas, Ancash, Peru. Surveys were made at 2200 to 4450 m of elevation. In all 38 species, 29 genera and 17 families, besides one imperfect taxon are are reported. A key of family, genera and species is included. Morphological and anatomical features are described for each species, including its chemical reaction, habitat and vouchers.